Un nanoporo logra leer proteínas aminoácido por aminoácido

Leer el ADN se volvió casi rutinario en muchos laboratorios, pero leer proteínas con el mismo nivel de detalle sigue siendo mucho más difícil. Un trabajo publicado en Nature presenta una estrategia que acerca ese objetivo: un sistema basado en nanoporo que puede seguir la secuencia de pequeños fragmentos de proteína un aminoácido a la vez, y distinguir incluso mutaciones puntuales o modificaciones químicas.

La idea combina dos movimientos. Primero, el péptido queda inmovilizado junto a un nanoporo modificado, una abertura tan pequeña que deja pasar moléculas individuales y produce señales eléctricas según lo que atraviesa. Después, una enzima va recortando el extremo de ese péptido paso a paso, siempre de a un aminoácido. Tras cada corte, el sistema vuelve a “leer” varias veces el nuevo extremo expuesto. Esa repetición genera señales más consistentes y, según los autores, permite reconstruir la secuencia con resolución de un solo aminoácido en lugar de depender de una sola medición breve y ruidosa.

El resultado importa porque las proteínas son las moléculas que ejecutan buena parte de las funciones del cuerpo y de las células, y pequeños cambios en su secuencia o en sus modificaciones pueden alterar enfermedades, diagnósticos y respuestas a tratamientos. El estudio mostró que la técnica no solo reconoce secuencias, sino que también puede identificar mutaciones de un único aminoácido, modificaciones posraduccionales e inserciones de aminoácidos no naturales. En otras palabras, no se limita a decir que hay una proteína: apunta a leer diferencias finas que muchas veces son las biológicamente más relevantes.

Eso no significa que la proteómica vaya a cambiar de un día para otro. El método se probó en péptidos inmovilizados y todavía está lejos de convertirse en una herramienta de uso amplio para muestras complejas como sangre o tejidos, donde conviven muchísimas proteínas distintas. También depende de una preparación experimental bastante controlada y de interpretar patrones eléctricos muy específicos. Aún así, el avance ofrece una prueba fuerte de principio: la secuenciación de proteínas por nanoporo, uno de los grandes objetivos pendientes de la biología molecular, parece un poco menos lejana.